さっきは泣きが入っていたので訳がわからないエントリを書いていましたが、やっと何とかなりました。
ひとまず
xampp
http://www.apachefriends.org/en/xampp-windows.html
でなんとかMySQLをインストールに成功。これでインストールできるということは私のやり方がどこか間違ってたんでしょう。もっとももうハマりたくはないので、次からはDebian上で構成します。
その後MyODBCをインストールしたら、Baseから接続できました。日本語は化け化けですが、これだけできているんであれば修正も早いのではないかと思います。